Der Ludwig-Noll-Verein ist ein eingetragener Verein und besteht verpflichtend aus einem von der Mitgliederversammlung gewählten Vorstand. Der Vorstand bevollmächtigt einen Geschäftsführer. Dieser ist den einzelnen Leitungen der verschiedenen Bereiche übergeordnet. Die Bereichsleitungen sind für folgende Abteilungen im Verein verantwortlich: Besondere Wohnform, Betreutes Wohnen, Betreutes Wohnen plus, Praxis für Ergotherapie, Psychosoziale Kontakt- und Beratungsstelle, Tagesstätte und Verwaltung. Außerdem gibt es einen Betriebsrat.